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SNP基因分型服務

基於過硬的引物合成及標記技術,多重 PCR擴增技術,測序技術,本公司推出SNP分型服務。分型方法包括:直接測序法、連接酶檢測反應(LDR)分型方法、多重SNaPshot SNP分型方法、MassArray分型方法以及Taqman探針法等,為廣大客户提供多樣的選擇!


多種分型平台

直接測序分型方法

連接酶檢測反應(LDR)分型方法

多重SnapShot 分型方法

Taqman探針分型方法


分型方法

技術特點

適宜樣本範圍

直接測序方法

1. Sanger法直接測序

2.準確性最高,“金標準”

3. 工作量大、費用高

適合少量樣本,位點數多且集中的分型檢測

連接酶檢測反應(LDR)方法

1. 適用於任何多態性位點,不需要人工引入酶切位點

2. 分型準確,其準確度可達95%以上

3. 檢出率高,週期短

4. 性價比高

 100-5000個樣品,1-20個位點

多重SnapShot 方法

1. 分型準確,其準確度達98%以上

2. 可多位點同時檢測

3. 不受SNP位點多態特性限制

4. 不受樣品個數的限制

100-5000個樣品,1-40個位點

Taqman探針法

1. 基於Taqman探針方法的熒光定量檢測

2. 使用MGB探針,可大大提高信噪比

3. 準確度高,但探針合成費用較貴

適合幾千個以上樣品,10個以下位點數的SNP檢測

 

服務優勢

1. 高質量完成數百萬個實驗數據

2. 已服務客户發表SCI文章近百篇

3. 已成功完成猴子、貝類、魚類等非常規種屬樣品的SNP分型

4. 已完成腦血管、各種癌症、高血壓、乙型肝炎等疾病相關位點幾千個


主要服務方案

1. 直接測序法

將待檢測片段進行PCR擴增並直接測序是SNP檢測方法中最準確的方法。純合位點為單峯,而雜合峯為套峯,因而很容易將幾種基因型區分開來。直接測序法不僅可用於對已知位點的檢測,還可用於發現未知的SNP位點。

 

2. 連接酶檢測反應(LDR)分型方法

技術原理:主要應用連接酶檢測反應 (ligase detection reaction,LDR)技術。即在Taq DNA連接酶的作用下,當左右兩條寡核苷酸探針與目的DNA序列完全互補,並且兩條探針之間沒有空隙時才能發生連接反應,否則連接反應不能進行,最後通過毛細管電泳,掃描片段長度,實現對SNP 位點的檢測。

 

 

3. 多重SNaPshot SNP分型方法

技術原理:SNaPshot SNP分型是一種以單鹼基延伸原理為基礎,同時利用多重PCR對多個已知SNP 位點進行基因分型的方法。在一個含有測序酶,四種熒光標記的ddNTP,緊挨多態位點5’端的不同長度延伸引物和PCR產物模板的反應體系中,引物延伸一個鹼基即終止,經ABI 3730XL 測序儀進行毛細管電泳後,根據峯的顏色可知摻入的鹼基種類,從而確定基因型,根據出峯位置確定該延伸產物對應的SNP位點。

 

 

4.Taqman 探針方法

在PCR 反應系統中加入2 種不同熒光標記的探針,它們可分別與2個等位基因完全配對。正常情況下,由於探針5′端熒光基團和3′端淬滅基團緊鄰在一起,熒光被淬滅。隨着PCR 的有效進行,與模板完全配對的探針逐步被Taq DNA 聚合酶5′→3′外切酶活性切割,致使探針5′端上的熒光基團與3′端的淬滅基團分離,淬滅效應解除,報告熒光基團被激活;而與模板不能完全配對的探針(代表另一種等位基因)不能被有效切割,故檢測不到熒光信號,通過相應儀器檢測熒光值的變化即可實現SNP位點檢測。

 

服務流程

l 課題的設計諮詢包括檢測位點的選取

l 根據實驗通量選用不同分型方法

l DNA樣本的質檢

l SNP分型所用引物和探針的設計、合成與優化

l SNP分型及數據分析


客户提供信息及樣品

1. SNP位點信息:

人類基因組需SNP位點的rs號;其它物種如牛、雞、魚等無rs號的,需SNP位點上下游各200bp的確切序列,SNP位點的突變類型,以及位點的上下游25bp內是否存在其它位點。

2. 分型樣品:

(1)若分型樣品為基因組DNA或質粒DNA ,樣品要求:DNA濃度≥20ng/ul,體積>10ul,位點較多的按照1ul/位點計算。純度 OD 260/OD280 在1.7~1.9之間。由於樣品質量差異過大導致的成功率下降,由客户負責。如果要求提供樣品純化服務,我們對每個樣品將收取純化費。

(2)若分型樣品為血樣,樣本要求:血液樣品,體積大於500ul,需用抗凝劑抗凝,送樣過程中請注意保持低温,防止DNA降解;血斑樣品,9-25mm2大小的血斑兩個以上。對每個血樣或血斑樣本將收取DNA提取費。

(3)客户在寄送樣品的時候,應在送樣包裹中放置足量的冰袋,以減少在運輸過程中因温度變化導致DNA降解的可能。請在每次寄出樣品後及時與本公司分型部聯繫,可以E-mail 或者傳真的方式告知樣品的詳細信息,以便收到樣品後能及時與您進行聯繫確認。

 

客户將得到結果

★SNPs分型結果(Excel表格)

★原始數據(SNP峯型圖)

★完整實驗報告包括擴增和反應的體系,所涉及的引物、探針序列等

 

文獻成果

捷瑞生物基因分型服務的客户已發表中英文文獻達百餘篇,點擊進入鏈接淘寶可下載更多SNP基因分型文章。

 

聯繫方式

郵箱:snp@generay.com.cn 

電話:021-67840429

 

 

 


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